万方查重软件对学术不端行为的检测方法主要包括：1.文本比对技术，通过与数据库中的文献进行比对，识别相似度高的内容；2.图像识别技术，检测插图和图片的原创性；3.数据库检索技术，查找相似的论文和资料；4.多维度比对技术，结合多种检测手段，提高查重的准确性。

除了上述方法外，万方查重软件还可以通过分析文本的语言风格、引用格式、逻辑结构等特征来判断是否存在学术不端行为。此外，万方查重软件还可以实现对中文、英文等多种语言的检测，为学术界提供了全方位的抄袭检测服务。